RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 EPHB6O15197 1021 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 INSIG1O15503 277 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CREB3O43889 395 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 COQ9O75208 318 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PROP1O75360 226 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PMPCBO75439 489 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CPNE6O95741 557 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 FERP16591 822 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RBL1P28749 1068 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HSPA7P48741 367 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HCAR3P49019 387 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CCL7P80098 99 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MYL5Q02045 173 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 BCL2L1Q07817 233 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 IL10RBQ08334 325 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RALGDSQ12967 914 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LY6DQ14210 128 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CLCA4Q14CN2 919 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 BRD3Q15059 726 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PCID2Q5JVF3 399 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RFX8Q6ZV50 586 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF566Q969W8 418 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1191Q96A73 305 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 AGPAT1Q99943 283 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SYT11Q9BT88 431 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 VPS16Q9H269 839 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 FGF22Q9HCT0 170 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PARVAQ9NVD7 372 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 OR1A2Q9Y585 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM202A6NGA9 273 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 STMND1H3BQB6 276 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 J3KR12 359 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PALMO75781 387 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 IGLV2-14P01704 120 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PCCBP05166 539 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PYGLP06737 847 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 GZMAP12544 262 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CCNB1P14635 433 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PTH2RP49190 550 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 KLK7P49862 253 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CSRP3P50461 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MAMLD1Q13495 774 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 DPYSQ14117 519 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MPEG1Q2M385 716 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PNCKQ6P2M8 343 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ZWILCHQ9H900 591 aa6.69□□□□□ -1.34
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