RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1orf189	Q5VU69	101 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	C16orf46	Q6P387	395 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF44	Q7L0R7	432 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCSK5	Q92824	1860 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MED26	O95402	600 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSL3	O95573	720 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HBQ1	P09105	142 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC166	P0CW27	439 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	STMN1	P16949	149 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	AP1S2	P56377	157 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAB1	Q13506	487 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD7	Q92527	254 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PYCR2	Q96C36	320 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXL8	Q96CD0	374 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GBP5	Q96PP8	586 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SGPP1	Q9BX95	441 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCND3	Q9UK17	655 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITPR2	Q14571	2701 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	HMX2	A2RU54	273 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	C21orf140	B9A014	251 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325		H0YGG7	62 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325		H7BY64	318 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CREG1	O75629	220 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNDBP1	O95273	360 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPPB	P16860	134 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PHB	P35232	272 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CASR	P41180	1078 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB10	P61026	200 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABAT	P80404	500 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDC20	Q12834	499 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERV3-1	Q14264	604 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLD3	Q8IV08	490 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFT20	Q8IY31	132 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR56A3	Q8NH54	315 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4K3	Q96R72	315 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYTH2	Q99418	400 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDC1	Q9BTX1	674 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	FUT8	Q9BYC5	575 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	DERL2	Q9GZP9	239 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACTL8	Q9H568	366 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNX7	Q9UNH6	387 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	HAT1	O14929	419 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM153B	P0C7A2	387 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD1D	P15813	335 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITGAX	P20702	1163 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALAS2	P22557	587 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTPN4	P29074	926 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLE2	P56282	527 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	DLG1	Q12959	904 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	BMPR2	Q13873	1038 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSHL1	Q14406	222 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC9A5	Q14940	896 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLMAP	Q14BN4	828 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAA25	Q14CX7	972 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM153C	Q494X1	144 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCTE1	Q5JU00	501 aa		15.13	■□□□□ 0.01

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