RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 EOMESO95936 686 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FGF1P05230 155 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 UGT2B15P54855 530 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GPR50Q13585 617 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KEAP1Q14145 624 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PROX2Q3B8N5 592 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR2T29Q8NH02 315 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ZNF675Q8TD23 568 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 EGLN2Q96KS0 407 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR52E6Q96RD3 313 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 EFCAB10A6NFE3 127 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FFAR3O14843 346 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD28O15084 1053 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GPR42O15529 346 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0513O60268 411 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 IL7P13232 177 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DPA1P20036 260 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 LETMD1Q6P1Q0 360 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PIANPQ8IYJ0 282 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GPR21Q99679 349 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 COQ3Q9NZJ6 369 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DNMT3LQ9UJW3 386 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CCDC182A6NF36 153 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 WBP4O75554 376 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RPS17P08708 135 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TNFSF8P32971 234 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MAGEA11P43364 429 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC11A1P49279 550 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CRISP3P54108 245 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DMC1Q14565 340 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 LINGO4Q6UY18 593 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPSM1Q86YR5 675 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DENND1CQ8IV53 801 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 WBP2Q969T9 261 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 OR2A14Q96R47 310 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DHRS9Q9BPW9 319 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GKN1Q9NS71 199 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PCM1Q15154 2024 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HMX3A6NHT5 357 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 F5H5T6 163 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TSC22D2O75157 780 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLITRK5O94991 958 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PRLP01236 227 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 STSP08842 583 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 UQCRC1P31930 480 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NKX3-2P78367 333 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MED22Q15528 200 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 YIF1BQ5BJH7 314 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FCGR1BQ92637 280 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 KCNC2Q96PR1 638 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TTPALQ9BTX7 342 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPR83Q9NYM4 423 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MUTYHQ9UIF7 546 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 IQCF5A8MTL0 148 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CA12O43570 354 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NIPSNAP2O75323 286 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PGRP06401 933 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SUOXP51687 545 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FAM189BP81408 668 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NPRL3Q12980 569 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TCTN1Q2MV58 587 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPAT3Q53EU6 434 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPR149Q86SP6 731 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 C10orf111Q8N326 155 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FAM109AQ8N4B1 249 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPR150Q8NGU9 434 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MYDGFQ969H8 173 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms