RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CRYL1Q9Y2S2 319 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CROCCQ5TZA2 2017 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 HYKKA2RU49 373 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 WIPF3A6NGB9 483 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 VSTM2BA6NLU5 285 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TARM1B6A8C7 271 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 IPO13O94829 963 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.483e-32■■□□□ 13.6
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PRAME-212ENST00000485532 KLC1Q07866 573 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 GBX1Q14549 363 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 RBBP7Q16576 425 aa12.05□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 ACSBG2Q5FVE4 666 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 EMBQ6PCB8 327 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SUSD1Q6UWL2 747 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CENPUQ71F23 418 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 IGDCC3Q8IVU1 814 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MPP5Q8N3R9 675 aa12.05□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 LPGAT1Q92604 370 aa12.05□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 C10orf90Q96M02 699 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 IL22Q9GZX6 179 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TSPYL1Q9H0U9 437 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZNF304Q9HCX3 659 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 BFARQ9NZS9 450 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.04□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 MAGEA4P43358 317 aa12.04□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 IGFL2Q6UWQ7 119 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 LINC00696Q6ZRV3 163 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 RNF44Q7L0R7 432 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 KCNMB4Q86W47 210 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 LRRC6Q86X45 466 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 RELL1Q8IUW5 271 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ANKMY2Q8IV38 441 aa12.04□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 HMGCLL1Q8TB92 370 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB14Q8TBM8 379 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TM9SF4Q92544 642 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AGAP4Q96P64 663 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SLC30A3Q99726 388 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 DPH7Q9BTV6 452 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CRB3Q9BUF7 120 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 KIFC1Q9BW19 673 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZNF160Q9HCG1 818 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ENAMQ9NRM1 1142 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SEMA3GQ9NS98 782 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SLC5A6Q9Y289 635 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 KLK4Q9Y5K2 254 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TEX264Q9Y6I9 313 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZGRF1Q86YA3 2104 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SVILO95425 2214 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OR2A25A4D2G3 310 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SDR42E2A6NKP2 422 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 H0YGG7 62 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AP3B1O00203 1094 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 E2F3O00716 465 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 KPNA5O15131 536 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 KLHL41O60662 606 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZGLP1P0C6A0 271 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CHRM3P20309 590 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CCNFP41002 786 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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