RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 XKR6Q5GH73 641 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 EOGTQ5NDL2 527 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 IL23RQ5VWK5 629 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 REP15Q6BDI9 236 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PDZD3Q86UT5 571 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 HPS6Q86YV9 775 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 KIRREL3Q8IZU9 778 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MIER2Q8N344 545 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 OXR1Q8N573 874 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB119Q8N690 84 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 RNF148Q8N7C7 305 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 KYQ8NBH2 561 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 OR56A3Q8NH54 315 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF480Q8WV37 535 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 RLN3Q8WXF3 142 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 VPS33AQ96AX1 596 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC138Q96M89 665 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 FOPNLQ96NB1 174 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 CDRT15Q96T59 188 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM8Q9BZR9 551 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 FOXQ1Q9C009 403 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 WDR41Q9HAD4 459 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 FGF22Q9HCT0 170 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PREBQ9HCU5 417 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 FZD4Q9ULV1 537 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SUFUQ9UMX1 484 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 GPR34Q9UPC5 381 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 INVSQ9Y283 1065 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 ASF1AQ9Y294 204 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.92□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 A0A096LPE4 126 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PPC1 479 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PPZ6 126 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 E7ENX8 843 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SLC28A1O00337 649 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MRASO14807 208 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 KMOO15229 486 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 NRP2O60462 931 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 ULK1O75385 1050 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 SEC22BO75396 215 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 EML2O95834 649 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 CHRNB1P11230 501 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 G6PDP11413 515 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 GLULP15104 373 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 EZRP15311 586 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 TEAD1P28347 426 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 HNMTP50135 292 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MNAT1P51948 309 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 DGKQP52824 942 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 THOP1P52888 689 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PSME3P61289 254 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 TBPL1P62380 186 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 ERVK-8P63133 956 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 PLIN5Q00G26 463 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 IRF8Q02556 426 aa5.91□□□□□ -1.46
SKAP2-204ENST00000481204 EMX2Q04743 252 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms