RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 FANCEQ9HB96 536 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 SH3GLB2Q9NR46 395 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 VPS28Q9UK41 221 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.85□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 EXPH5Q8NEV8 1989 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 TFECO14948 347 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ITGA10O75578 1167 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 NCR1O76036 304 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 LCA5LO95447 670 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 TGFAP01135 160 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 GASTP01350 101 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 F3P13726 295 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 SCP2P22307 547 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 MGAT1P26572 445 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 GABRB2P47870 512 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 PPP1CAP62136 330 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 NHLH2Q02577 135 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ELP6Q0PNE2 266 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CARD16Q5EG05 197 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 TTC22Q5TAA0 569 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 Q6YL49 198 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 BLIDQ8IZY5 108 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 LGI2Q8N0V4 545 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 OR1L3Q8NH93 324 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 KIAA1191Q96A73 305 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CD180Q99467 661 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CITED1Q99966 193 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 B9D2Q9BPU9 175 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 PIGQQ9BRB3 760 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 TIPINQ9BVW5 301 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 SYTL2Q9HCH5 934 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 CDYLQ9Y232 598 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 NFS1Q9Y697 457 aa4.84□□□□□ -1.63
OPTN-209ENST00000469025 DOCK7Q96N67 2140 aa4.84□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 BCKDKO14874 412 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 WDR1O75083 606 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 NUDT3O95989 172 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 LPLP06858 475 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 UQCRHP07919 91 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 RBP3P10745 1247 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 LYL1P12980 280 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 CRYGSP22914 178 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 CTSSP25774 331 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 CCR8P51685 355 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 SUOXP51687 545 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 LGALS4P56470 323 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 NPY5RQ15761 445 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 RBBP7Q16576 425 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 PNCKQ6P2M8 343 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 ABHD13Q7L211 337 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 NAXEQ8NCW5 288 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 RNF139Q8WU17 664 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 ZNF480Q8WV37 535 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 PROX1Q92786 737 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 MARK4Q96L34 752 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 PSMB7Q99436 277 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 JKAMPQ9P055 326 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 DKK2Q9UBU2 259 aa4.83□□□□□ -1.64
OPTN-209ENST00000469025 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.83□□□□□ -1.64
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