RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.1□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 F8P00451 2351 aa11.1□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 PDZD2O15018 2839 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 E5RI56 91 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 MYO1CO00159 1063 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 PCDH17O14917 1159 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 P2RX6O15547 441 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 WFS1O76024 890 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 MATN4O95460 622 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 ITGAMP11215 1152 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 CHRM3P20309 590 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 FDXRP22570 491 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 ATP5DP30049 168 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 EFNA3P52797 238 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 GBX1Q14549 363 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 INAQ16352 499 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 PLD3Q8IV08 490 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 SMPDL3AQ92484 453 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 MVB12AQ96EY5 273 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 DRC3Q9H069 523 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 GALPQ9UBC7 116 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.09□□□□□ -0.63
GARNL3-210ENST00000453030 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1W2PQ72 361 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 H3BMM5 538 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 HAT1O14929 419 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 FOXS1O43638 330 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PHF2O75151 1096 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 UNC5CO95185 931 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CCNDBP1O95273 360 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 BMP10O95393 424 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 WDPCPO95876 746 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ESR1P03372 595 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CATP04040 527 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SLC26A3P40879 764 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 NPY2RP49146 381 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PNLIPRP1P54315 467 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PMP22Q01453 160 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF33BQ06732 778 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CUL1Q13616 776 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 KCNJ11Q14654 390 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PCOLCEQ15113 449 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ICE2Q659A1 982 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF425Q6IV72 752 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 NEK10Q6ZWH5 1172 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SPC24Q8NBT2 197 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PKP4Q99569 1192 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 KIFC1Q9BW19 673 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SOX13Q9UN79 622 aa11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SMAPO00193 183 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PFDN6O15212 129 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RASAL1O95294 804 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SLC16A8O95907 504 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MST1P26927 711 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 KCNJ1P48048 391 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 VPS41P49754 854 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 EMP3P54852 163 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RPS6KA1Q15418 735 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms