RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 EPOP01588 193 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PRSS56P0CW18 603 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 MYBL1P10243 752 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 GZMAP12544 262 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TACR1P25103 407 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PTPN3P26045 913 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ACVR2AP27037 513 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ADH7P40394 386 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SLC26A3P40879 764 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 CYB561P49447 251 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ITGA8P53708 1063 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TAS2R50P59544 299 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 GPR85P60893 370 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 XIAPP98170 497 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 UBXN1Q04323 297 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PDK1Q15118 436 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PDK2Q15119 407 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SYTL3Q4VX76 610 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 FIGNQ5HY92 759 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PAOXQ6QHF9 649 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SNX20Q7Z614 316 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SULF2Q8IWU5 870 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 AMER3Q8N944 861 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SLCO2A1Q92959 643 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM11Q96F44 468 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TEKT5Q96M29 485 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 RNF157Q96PX1 679 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 CYTH2Q99418 400 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 MIPEPQ99797 713 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 GTF3C1Q12789 2109 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 AGAP14A8MT82 685 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TARM1B6A8C7 271 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 H0YGG7 62 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 MYO1FO00160 1098 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SYT5O00445 386 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PEX1O43933 1283 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SMPD2O60906 423 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 IFNA2P01563 188 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PSMB5P28074 263 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 MC4RP32245 332 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PEX19P40855 299 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGAP25P42331 645 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TAS2R40P59535 323 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 DYNLT1P63172 113 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 EXT1Q16394 746 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 HKDC1Q2TB90 917 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PID1Q7Z2X4 250 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SHISA5Q8N114 240 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 PLD5Q8N7P1 536 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 LINC01560Q8TB33 94 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 M1APQ8TC57 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 RAPGEF5Q92565 580 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF592Q92610 1267 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 FAF2Q96CS3 445 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 APOL2Q9BQE5 337 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 FICDQ9BVA6 458 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 SARGQ9BW04 601 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-222ENST00000449504 MMP25Q9NPA2 562 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms