RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 MTM1Q13496 603 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ASAH1Q13510 395 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF234Q14588 700 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF235Q14590 738 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KARSQ15046 597 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 DUSP6Q16828 381 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 DUSP7Q16829 419 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF284Q2VY69 593 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PGGHGQ32M88 737 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TUBB8Q3ZCM7 444 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 Q5BKY6 102 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TRIM61Q5EBN2 209 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KCNT1Q5JUK3 1230 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ELFN2Q5R3F8 820 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FAAH2Q6GMR7 532 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RAB12Q6IQ22 244 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SLC27A1Q6PCB7 646 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MFSD7Q6UXD7 560 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 LRRC31Q6UY01 552 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FGD2Q7Z6J4 655 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KBTBD6Q86V97 674 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 C11orf74Q86VG3 221 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SLC47A2Q86VL8 602 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CLYBLQ8N0X4 340 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 LINC01561Q8N1V8 128 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FBXO39Q8N4B4 442 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RNF182Q8N6D2 247 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KLHDC1Q8N7A1 406 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 KIAA1958Q8N8K9 716 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 FAM156AQ8NDB6 213 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RHOXF1Q8NHV9 184 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RFWD2Q8NHY2 731 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 IL31RAQ8NI17 732 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 GIPC2Q8TF65 315 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SLC44A1Q8WWI5 657 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SUSD6Q92537 303 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SEMA4DQ92854 862 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 HPS3Q969F9 1004 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ARRDC3Q96B67 414 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 HAVCR1Q96D42 359 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 NECTIN4Q96NY8 510 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 STK33Q9BYT3 514 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MAGT1Q9H0U3 335 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RNF167Q9H6Y7 350 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MINDY3Q9H8M7 445 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 LMAN1LQ9HAT1 526 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SPAG4Q9NPE6 437 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 SNX15Q9NRS6 342 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 ATAD3AQ9NVI7 634 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 NUP50Q9UKX7 468 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 TNNQ9UQP3 1299 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa-0.72□□□□□ -2.52
SNORD57-201ENST00000448188 THADAQ6YHU6 1953 aa-0.72□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.72□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.72□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.72□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 NEO1Q92859 1461 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 A0A0D9SG52 128 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 A0A0G2JMM0 328 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 A0A0G2JPF8 293 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 A0A0U1RQJ8 604 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1W2PPB8 328 aa-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms