RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FNDC8Q8TC99 324 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FKBP10Q96AY3 582 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TIFAQ96CG3 184 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MAGED4Q96JG8 741 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 EXD2Q9NVH0 621 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 EPN2O95208 641 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ETHE1O95571 254 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LAMP1P11279 417 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DAPP51397 102 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 BNIP3Q12983 259 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CDK5R2Q13319 367 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 NAE1Q13564 534 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RAPSNQ13702 412 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GALNT10Q86SR1 603 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC138Q96M89 665 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TDP1Q9NUW8 608 aa15.49■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PLXNA2O75051 1894 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 BCKDKO14874 412 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 NPC1O15118 1278 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC159P0C7I6 412 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PCMT1P22061 227 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 IGFBP5P24593 272 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 EPHA5P54756 1037 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LAPTM4AQ15012 233 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MUL1Q969V5 352 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF566Q969W8 418 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 QSOX1O00391 747 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CLTBP09497 229 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HNF4AP41235 474 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PREPP48147 710 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 VLDLRP98155 873 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 KDM4DQ6B0I6 523 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 XKR5Q6UX68 686 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CBLL1Q75N03 491 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CPA6Q8N4T0 437 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ATL1Q8WXF7 558 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GLMNQ92990 594 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MTG2Q9H4K7 406 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PSME2Q9UL46 239 aa15.48■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HSD3B1P14060 373 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HSD3B2P26439 372 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 IMPA1P29218 277 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GTF2H3Q13889 308 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM159Q96B96 161 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 VPS35Q96QK1 796 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 BRF2Q9HAW0 419 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 M0QX08 132 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SLC16A8O95907 504 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ITIH1P19827 911 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 BDKRB1P46663 353 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PRLHRP49683 370 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 DPPA4Q7L190 304 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 NAT16Q8N8M0 369 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-202ENST00000444040 OR56A3Q8NH54 315 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms