RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SOHLH2Q9NX45 425 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 KIF26BQ2KJY2 2108 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GTL3 188 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 NRP2O60462 931 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PRAMEF4O60810 478 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CLDN9O95484 217 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 THRAP10827 490 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ARRB2P32121 409 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SLC1A6P48664 564 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SEPHS1P49903 392 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 DOC2AQ14183 400 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 DHRS13Q6UX07 377 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 MILR1Q7Z6M3 343 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SLCO6A1Q86UG4 719 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 OR4F6Q8NGB9 312 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 AGAP11Q8TF27 550 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZUFSPQ96AP4 578 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 MAGEB18Q96M61 343 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ANKMY1Q9P2S6 941 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 UGDHO60701 494 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 WFS1O76024 890 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 EBLN1P0CF75 366 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CDK4P11802 303 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 GRK3P35626 688 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ARL4DP49703 201 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PKNOX1P55347 436 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SH3BP2P78314 561 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CSNK1G2P78368 415 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 TBCCQ15814 346 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 FCRL6Q6DN72 434 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF425Q6IV72 752 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SYVN1Q86TM6 617 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CUZD1Q86UP6 607 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PAQR7Q86WK9 346 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SLITRK4Q8IW52 837 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 LSMEM2Q8N112 164 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 WDR34Q96EX3 536 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 AIF1LQ9BQI0 150 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 EFCAB11Q9BUY7 163 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PDP2Q9P2J9 529 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 RNF11Q9Y3C5 154 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 DCDC2BA2VCK2 349 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 OR2A25A4D2G3 310 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 KLF11O14901 512 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 HAT1O14929 419 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K7O43318 606 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ITM2AO43736 263 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PRAMEF10O60809 474 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CRCPO75575 148 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 OR4F21O95013 312 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ESRRBO95718 433 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CD22P20273 847 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 MDH1P40925 334 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ERVPABLB-1P60509 514 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH1Q08174 1060 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZIC1Q15915 447 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PAGE2BQ5JRK9 111 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 LIPJQ5W064 366 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 LETMD1Q6P1Q0 360 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 OR4K1Q8NGD4 311 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 SPNS1Q9H2V7 528 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF225Q9UK10 706 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 KLK4Q9Y5K2 254 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 FEZF1A0PJY2 475 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD34CP0C6C1 535 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CXCR2P25025 360 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 HNF4AP41235 474 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CASP2P42575 452 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 PDX1P52945 283 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 GYS2P54840 703 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 REEP5Q00765 189 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 LAPTM5Q13571 262 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 GRHL2Q6ISB3 625 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXA4-202ENST00000428284 FAM129CQ86XR2 697 aa19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms