RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GPR180Q86V85 440 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 OR2T12Q8NG77 320 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 BIRC7Q96CA5 298 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 CDH1P12830 882 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 KIR3DL1P43629 444 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 E2F2Q14209 437 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ATG9BQ674R7 924 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf111Q8N326 155 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 BTBD9Q96Q07 612 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 BATF3Q9NR55 127 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK6Q9Y257 313 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 C1QCP02747 245 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ACPPP15309 386 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 KELP23276 732 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 FXNQ16595 210 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ITCHQ96J02 903 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 SLC29A1Q99808 456 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 RMND5AQ9H871 391 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 INVSQ9Y283 1065 aa22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TGFB1P01137 390 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GBAP04062 536 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 HSD3B1P14060 373 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 COX7A2P14406 83 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PRPS1L1P21108 318 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 HSD3B2P26439 372 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 IGFALSP35858 605 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2CBP62714 309 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2CAP67775 309 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 FIG4Q92562 907 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MIEF2Q96C03 454 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 NSMCE2Q96MF7 247 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 KCNH6Q9H252 994 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 SAC3D1A6NKF1 404 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MYO1DO94832 1006 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GPIP06744 558 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 HKDC1Q2TB90 917 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PROSER1Q86XN7 944 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.36■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 A0A096LPI6 279 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PI15O43692 258 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ERN1O75460 977 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN6P29350 595 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 REPS1Q96D71 796 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 HHIPQ96QV1 700 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 VCXQ9H320 206 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 OR51B5Q9H339 312 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TAC3Q9UHF0 121 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 RFXANKO14593 260 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 LYNP07948 512 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GGT1P19440 569 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PSMB5P28074 263 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TCEA2Q15560 299 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 HORMAD1Q86X24 394 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 TRPV3Q8NET8 790 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 WDR34Q96EX3 536 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 GBP5Q96PP8 586 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-209ENST00000428120 CENPKQ9BS16 269 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms