RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP4Q13115 394 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 TIGD6Q17RP2 521 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6F1Q8NGZ6 308 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCG8Q9H221 673 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNH6Q9H252 994 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH7Q9H992 704 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 NPAP1Q9NZP6 1156 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 MICAL3Q7RTP6 2002 aa17.78■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNDBP1O95273 360 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 MED26O95402 600 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 GNRH1P01148 92 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 S100A3P33764 101 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS4P49798 205 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFA1P59665 94 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFA3P59666 94 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD18Q0P651 414 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ATAD3CQ5T2N8 411 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 DOK6Q6PKX4 331 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG16L2Q8NAA4 619 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJB8Q8NHS0 232 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR62Q9BZJ7 368 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF167Q9H6Y7 350 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM161AQ9NX61 479 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 GPRC5BQ9NZH0 403 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ZW10O43264 779 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 SSX4O60224 188 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN11O75508 207 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 APOA1P02647 267 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 KLKB1P03952 638 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 EBLN1P0CF75 366 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 EPB42P16452 691 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGCLP35914 325 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC11A2P49281 568 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CSNK2BP67870 215 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 NPRL3Q12980 569 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF7Q14155 803 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 HORMAD1Q86X24 394 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 USP7Q93009 1102 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 SCLYQ96I15 445 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 NTMT1Q9BV86 223 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 LATS2Q9NRM7 1088 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ASIC5Q9NY37 505 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 EHD3Q9NZN3 535 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D14Q9P2M4 693 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 PPT2Q9UMR5 302 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa17.77■□□□□ 0.44
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 E9PQ18 207 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PDYNP01213 254 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FABP3P05413 133 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2B6P58173 313 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 VLDLRP98155 873 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ELP6Q0PNE2 266 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF544Q6NX49 715 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KBTBD8Q8NFY9 601 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 EGLN2Q96KS0 407 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SIRT5Q9NXA8 310 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPS1Q9UHF7 1281 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX16Q9Y5Y5 336 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SCO2O43819 266 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX4O95219 450 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC19A1P41440 591 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6K2Q8NGY2 324 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DHRS1Q96LJ7 313 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CASD1Q96PB1 797 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX18Q96RF0 628 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 NUAK2Q9H093 628 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB8Q9H765 288 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GKN1Q9NS71 199 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms