RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM205Q6UW68 189 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPTNQ6XPR3 784 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAQR7Q86WK9 346 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD6BQ8N6M0 293 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9A1PQ8NGU1 263 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB8Q8NHS0 232 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUN3Q8TAQ9 357 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMPDL3AQ92484 453 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HES6Q96HZ4 224 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF700Q9H0M5 742 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST11Q9NPF2 352 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAK5Q9P286 719 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF148Q9UQR1 794 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXS1O43638 330 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF2O60811 474 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIPSNAP2O75323 286 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMBRP28336 390 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR1EP28566 365 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFNA3P52797 238 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRADDP78560 199 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBPJQ06330 500 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUSD1Q6UWL2 747 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAS2L3Q86XJ1 694 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC89Q8N998 374 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIRC8Q96P09 236 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBB6Q9BUF5 446 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRC3Q9H069 523 aa12.49□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO1CO00159 1063 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNDBP1O95273 360 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf89P0DMQ9 161 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICAM2P13598 275 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX6B1P14854 86 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARNTP27540 789 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIPPLY3P57055 190 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMP22Q01453 160 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF33BQ06732 778 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF5AQ12840 1032 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP19Q14CB8 494 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LONRF1Q17RB8 773 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT16Q17RD7 645 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYSND1Q2T9J0 566 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICE2Q659A1 982 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF425Q6IV72 752 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC8BQ6P9F7 803 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMER2Q8N7J2 671 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf54Q8WWF1 131 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPGAT1Q92604 370 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LURAP1Q96LR2 239 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMMP1LQ96LU5 166 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A5Q96R48 311 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL22Q9GZX6 179 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAC3Q9UHF0 121 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCYOX1Q9UHG3 505 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEKT2Q9UIF3 430 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKL2Q9ULH7 1088 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8P00451 2351 aa12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BMM5 538 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNDC9O14530 226 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RX6O15547 441 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYBL2P10244 700 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKMP14618 531 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FMO4P31512 558 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM53BQ14153 422 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRNIPQ6NTE8 343 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM136AQ96C01 138 aa12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms