RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRG2BQ96QU4 278 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD180Q99467 661 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPH7Q9BTV6 452 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MANBAO00462 879 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF195O14628 629 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD59P13987 128 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CKMT2P17540 419 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TGM1P22735 817 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINB3P29508 390 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINB1P30740 379 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIA3P42263 894 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 AQP5P55064 265 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 INHBCP55103 352 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSNK1G2P78368 415 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 REEP5Q00765 189 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RELAQ04206 551 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF425Q6IV72 752 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADCK2Q7Z695 626 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT6BQ92526 530 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCSTNQ92542 709 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SARGQ9BW04 601 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUF2Q9BZD4 464 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCG4Q9H172 646 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARD6AQ9NPB6 346 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP34Q70CQ2 3546 aa16.28■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JND7 137 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBC2A0A5B9 178 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERTM1A2A2V5 107 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFAB1O14561 156 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FFAR3O14843 346 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR42O15529 346 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTM2P28161 218 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD1CP29017 333 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTKQ06187 659 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRGCQ6NXR0 463 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPGNQ6UW88 154 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAXDQ8IW45 347 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDIASQ8IXT1 998 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTLQ8NG68 377 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR7G3Q8NG95 312 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFWD2Q8NHY2 731 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFI44Q8TCB0 444 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP7Q93009 1102 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf60Q96EN9 201 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNK13Q9HB14 408 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2A25A4D2G3 310 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TLCD2A6NGC4 264 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIP5K1BO14986 540 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS4BO75351 444 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9P02748 559 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GP1BAP07359 652 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGP20916 626 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDH3P22223 829 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACP1P24666 158 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIK3CBP42338 1070 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARFIP2P53365 341 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHEXP78562 749 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMZ1Q400G9 498 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PERM1Q5SV97 790 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAVSQ7Z434 540 aa16.26■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms