RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 BCHEP06276 602 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MYBPC3Q14896 1274 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 OGFOD2Q6N063 350 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM135Q86UB9 458 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMC5Q96C12 935 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 LRCH3Q96II8 777 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ING3Q9NXR8 418 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 M0QX08 132 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 AGR2O95994 175 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 STATHP02808 62 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RHOP08100 348 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TGFBR2P37173 567 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR68Q15743 365 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB6CQ53S08 254 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NEK7Q8TDX7 302 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SCAMP4Q969E2 229 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD9AQ99638 391 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CSF2RAP15509 400 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 XKP51811 444 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 GRM2Q14416 872 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PKP4Q99569 1192 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 STC2O76061 302 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 GNSP15586 552 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 EOGTQ5NDL2 527 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM74Q86UV6 250 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF382Q96SR6 550 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 AHCYP23526 432 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RTP2Q5QGT7 225 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF186Q9NXI6 227 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 GBAP04062 536 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RLN1P04808 185 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 BIRC7Q96CA5 298 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN25C9JDP6 229 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CREG1O75629 220 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CD1DP15813 335 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB8AP61006 207 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MADCAM1Q13477 382 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNC3Q14003 757 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH24Q86UP0 819 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf78A6NCI8 922 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DMPKQ09013 629 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 UFD1Q92890 307 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 KAT6AQ92794 2004 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 REM1O75628 298 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CNMDO75829 334 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 OAZ2O95190 189 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CCKBRP32239 447 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 APLP1P51693 650 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNC2Q96PR1 638 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SNX4O95219 450 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 S1PR4O95977 384 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP4BP51164 291 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms