RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 MT-ND1P03886 318 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATP1B1P05026 303 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RB1P06400 928 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 GP1BBP13224 206 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANPEPP15144 967 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELK1P19419 428 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACSL1P33121 698 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NDST2P52849 883 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDH8P55286 799 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ERVK-16P61578 105 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRAMEP78395 509 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACY1Q03154 408 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SGCGQ13326 291 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NR1D2Q14995 579 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM95Q3KNT9 176 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NHLRC3Q5JS37 347 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMCO3Q6UWJ1 677 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PAMR1Q6UXH9 720 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TIFABQ6ZNK6 161 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IKBIPQ70UQ0 350 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NUP54Q7Z3B4 507 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PXKQ7Z7A4 578 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CEP57Q86XR8 500 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CPXCR1Q8N123 301 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM89BQ8N5H3 189 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IL17REQ8NFR9 667 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KIAA1524Q8TCG1 905 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RFFLQ8WZ73 363 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OCR1Q9BZK8 76 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAI2Q9GZS0 605 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPATC1LQ9H0A9 340 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 HRH4Q9H3N8 390 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OPA3Q9H6K4 179 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 JMJD4Q9H9V9 463 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 UBN1Q9NPG3 1134 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 LUZP4Q9P127 313 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SELENOKQ9Y6D0 94 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SALL1Q9NSC2 1324 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A1B0GTH9 108 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 LNP1A1A4G5 178 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC189A1A4V9 331 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 K7EQG2 157 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SURF4O15260 269 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TSPAN1O60635 241 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF253O75346 499 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM63AO94886 807 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEMA4FO95754 770 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DDX58O95786 925 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGHV2-70P01814 119 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MYOGP15173 224 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNASE1P24855 282 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 EDNRAP25101 427 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MPZP25189 248 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 FASP25445 335 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAPK4P31152 587 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MATKP42679 507 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RIDAP52758 137 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAPK12P53778 367 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IST1P53990 364 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DCDC1P59894 354 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SIRPAP78324 504 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CXCL9Q07325 125 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRKG2Q13237 762 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 VEZF1Q14119 521 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRIM29Q14134 588 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DUSP5Q16690 384 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC22A6Q4U2R8 563 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGSF11Q5DX21 431 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 GORABQ5T7V8 394 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR4C11Q6IEV9 310 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 EMBQ6PCB8 327 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMTC3Q6ZXV5 915 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 FCRLAQ7L513 359 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERINC5Q86VE9 423 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NAXDQ8IW45 347 aa0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms