RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BEST4Q8NFU0 473 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPAS2Q99743 824 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HAUS8Q9BT25 410 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STRADBQ9C0K7 418 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APMAPQ9HDC9 416 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 U3KQK5 164 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRIP11Q15643 1979 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 F8P00451 2351 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHD8Q9HCK8 2581 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CACNA1BQ00975 2339 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COL4A2P08572 1712 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C5orf60A6NFR6 353 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CAPN8A6NHC0 703 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C4orf51C9J302 202 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 G3V2L1 256 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBXN7O94888 489 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEMA4FO95754 770 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TGM6O95932 706 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD74P04233 296 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASLP04424 464 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADORA3P0DMS8 318 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PBX1P40424 430 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TECP42680 631 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC1A4P43007 532 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NT5C2P49902 561 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD164Q04900 197 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STK3Q13188 491 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MFAP5Q13361 173 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SART3Q15020 963 aaKnown RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAB1Q15750 504 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TPRXLQ17RH7 258 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EOGTQ5NDL2 527 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC30A9Q6PML9 568 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 B3GNT9Q6UX72 402 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA0408Q6ZU52 694 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPAINQ86UA6 219 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRIM74Q86UV6 250 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRIM73Q86UV7 250 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAP7D3Q8IWC1 876 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAJC22Q8N4W6 341 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TEX19Q8NA77 164 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AGBL3Q8NEM8 1001 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VSIG2Q96IQ7 327 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAR2Q96K12 515 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NDFIP1Q9BT67 221 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPATA9Q9BWV2 254 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZMYND12Q9H0C1 365 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIF9Q9HAQ2 790 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZFP14Q9HCL3 533 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTTG2Q9NZH5 202 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VPS51Q9UID3 782 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MPDZO75970 2070 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CADP27708 2225 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGEF35A5YM69 484 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 F2P00734 622 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL4P05112 153 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LIPFP07098 398 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZP3P21754 424 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPRP35270 261 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GSTM5P46439 218 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLDN2P57739 230 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CSNK2BP67870 215 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRMP1Q14194 572 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC57Q2TAC2 916 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BROXQ5VW32 411 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASCL5Q7RTU5 278 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRTM3Q86VH5 581 aa-2.31□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms