RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIPT1Q9Y234 373 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHKBQ9Y259 395 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A0U1RQK1 487 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF320A2RRD8 509 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 A4D1N5 150 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRR23AA6NEV1 266 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 H0YAE9 185 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCER2I3L3R5 266 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRAF2O60831 178 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDK2AP2O75956 126 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TGDSO95455 350 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEC24AO95486 1093 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 VTNP04004 478 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 RLN1P04808 185 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SERPING1P05155 500 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD48P09326 243 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CFC1BP0CG36 223 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CFC1P0CG37 223 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 STAG3L1P0CL83 205 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LHCGRP22888 699 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP2K2P36507 400 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNA2P51530 1060 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL10RBQ08334 325 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM29Q14134 588 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLMAPQ14BN4 828 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 E2F5Q15329 346 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TEAD2Q15562 447 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM166AQ6J272 317 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF790Q6PG37 636 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM207Q6UWW9 146 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF329Q86UD4 541 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SIAH3Q8IW03 269 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 APCDD1Q8J025 514 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 AMER3Q8N944 861 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRTM2Q8N967 370 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 AFAP1L1Q8TED9 768 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 GATAD1Q8WUU5 269 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNASE2BQ8WZ79 361 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TEKT1Q969V4 418 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CENPTQ96BT3 561 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRR1Q96L50 414 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 C10orf90Q96M02 699 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 AK8Q96MA6 479 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLHL5Q96PQ7 755 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ASCL2Q99929 193 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIGQQ9BRB3 760 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SDCBP2Q9H190 292 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNX25Q9H3E2 840 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR6C2Q9NZP2 312 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLK4Q9Y5K2 254 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 R4GN57 208 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A087WW49 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A0B4J203 849 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 MSGN1A6NI15 193 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 KBTBD13C9JR72 458 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TEX28O15482 410 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC01565O15544 149 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ST8SIA3O43173 380 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 IGKV3-20P01619 116 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 AMBPP02760 352 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CEACAM1P13688 526 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ALDH4A1P30038 563 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHRNB4P30926 498 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOAT1P35610 550 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 FRKP42685 505 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 IER3P46695 156 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNJ10P78508 379 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 SULT2A1Q06520 285 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 EXT1Q16394 746 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF74Q16587 644 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 LCN1P1Q5VSP4 162 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms