RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CXCR2P25025 360 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 ALDH3A1P30838 453 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 TSPAN7P41732 249 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 SERPINB4P48594 390 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 GPS2Q13227 327 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 TBCCQ15814 346 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 HSP90B2PQ58FF3 399 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 DNAJC22Q8N4W6 341 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 WDR34Q96EX3 536 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 MED4Q9NPJ6 270 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 EFCAB7A8K855 629 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 PLD2O14939 933 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 BIRC5O15392 142 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 EBLN1P0CF75 366 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CASP2P42575 452 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 NAGLUP54802 743 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 IRF8Q02556 426 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 E2F2Q14209 437 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 RNF44Q7L0R7 432 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM129CQ86XR2 697 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 ANKRD42Q8N9B4 389 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 SELENOSQ9BQE4 189 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 AIF1LQ9BQI0 150 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 SARGQ9BW04 601 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 OCIAD1Q9NX40 245 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 PILRAQ9UKJ1 303 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 PLCL2Q9UPR0 1127 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CTSVO60911 334 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 WFS1O76024 890 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 FOLR1P15328 257 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 SH3BP2P78314 561 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CLCQ05315 142 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CHIT1Q13231 466 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNAB1Q14722 419 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 XKR6Q5GH73 641 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 TBC1D19Q8N5T2 526 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 BMPERQ8N8U9 685 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 EFCAB11Q9BUY7 163 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 FANCEQ9HB96 536 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 FBXO8Q9NRD0 319 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 KIF26BQ2KJY2 2108 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 UGDHO60701 494 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 JMJD7P0C870 316 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 HPDP32754 393 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 GABRA4P48169 554 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 MC2RQ01718 297 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 LAPTM5Q13571 262 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CFAP157Q5JU67 520 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 HHATQ5VTY9 493 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 NUDCD3Q8IVD9 361 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 CCNYL1Q8N7R7 359 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 ATP6V1E2Q96A05 226 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 THAP11Q96EK4 314 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 MECRQ9BV79 373 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 NTMT1Q9BV86 223 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 FGF21Q9NSA1 209 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC22A23-201ENST00000380298 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 MLYCDO95822 493 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 CCL4P13236 92 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 CCNG1P51959 295 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 CDH13P55290 713 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 REEP5Q00765 189 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 DOC2AQ14183 400 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 IL11RAQ14626 422 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 PAGE2BQ5JRK9 111 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 OR8K5Q8NH50 307 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 ACTR8Q9H981 624 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 WASF3Q9UPY6 502 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 STK38LQ9Y2H1 464 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 TRBC2A0A5B9 178 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 AGRPO00253 132 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 HAT1O14929 419 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 NRP2O60462 931 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 PRAMEF4O60810 478 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 OTCP00480 354 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 VARSP26640 1264 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 RAB15P59190 212 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 FOXM1Q08050 763 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 TUBB3Q13509 450 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 C3orf38Q5JPI3 329 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 LIPJQ5W064 366 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC22A23-201ENST00000380298 MARCH9Q86YJ5 346 aa26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms