RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 REEP5Q00765 189 aa23.64■■□□□ 1.38
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ECHDC3-201ENST00000379215 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 ANKMY1Q9P2S6 941 aa23.62■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 SEC22BO75396 215 aa23.61■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 ZIM2Q9NZV7 527 aa23.61■■□□□ 1.37
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.61■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 CSNK1G2P78368 415 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.6■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 SERPINI1Q99574 410 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHDC3-201ENST00000379215 DMRT3Q9NQL9 472 aa23.6■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 SLC5A12Q1EHB4 618 aa23.59■■□□□ 1.37
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ECHDC3-201ENST00000379215 DEFB133Q30KQ1 61 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHDC3-201ENST00000379215 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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