RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 KLHL1Q9NR64 748 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SCN1AP35498 2009 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SNX4O95219 450 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 GPX3P22352 226 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 CD47Q08722 323 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 GTDC1Q4AE62 458 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 KCTD11Q693B1 232 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 LUZP2Q86TE4 346 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 HOMEZQ8IX15 550 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SVOPLQ8N434 492 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 KAT2AQ92830 837 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 RELTQ969Z4 430 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TADA1Q96BN2 335 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.94□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TNFRSF11BO00300 401 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 PCDH7O60245 1069 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 DNTTP04053 509 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 USP7Q93009 1102 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 CD244Q9BZW8 370 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 MAP10Q9P2G4 905 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 H0YJX3 145 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 I6L893 689 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TSPAN19P0C672 248 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ATF6P18850 670 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TALDO1P37837 337 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 KCNC1P48547 511 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TMBIM6P55061 237 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 DEFB103AP81534 67 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ELP6Q0PNE2 266 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 LCN8Q6JVE9 175 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 VITQ6UXI7 678 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 STMN3Q9NZ72 180 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SMIM30A4D0T7 59 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SLC22A1O15245 554 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 BPIP17213 487 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 FPGSQ05932 587 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TIGD6Q17RP2 521 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 PYDC2Q56P42 97 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 PGBD5Q8N414 524 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SCAIQ8N9R8 606 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZNF347Q96SE7 839 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TREX1Q9NSU2 369 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZNF221Q9UK13 617 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 INSL6Q9Y581 213 aa14.93□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 PLK4O00444 970 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 EFCAB14O75071 495 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 MYL12AP19105 171 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 HMGCLP35914 325 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 FAM129CQ86XR2 697 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 IRF7Q92985 503 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SPATA2Q9UM82 520 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TTC3P53804 2025 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 TSPAN6O43657 245 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 KLK1P06870 262 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 HSD17B1P14061 328 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 MATN1P21941 496 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 MAGEA8P43361 318 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 BORAQ6PGQ7 559 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.92□□□□□ -0.02
FGD1-201ENST00000375135 IL26Q9NPH9 171 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms