RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RPP38P78345 283 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MVKQ03426 396 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TLR1Q15399 786 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SPANXN4Q5MJ08 99 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf80Q86SX3 495 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TEPSINQ96N21 525 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PKP4Q99569 1192 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CYB5AP00167 134 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CREB5Q02930 508 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 NPTX1Q15818 432 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 UPP1Q16831 310 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF783Q6ZMS7 281 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CLCC1Q96S66 551 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SP140LQ9H930 580 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 LMO7Q8WWI1 1683 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GNB5O14775 395 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A1O15245 554 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF12P17014 697 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FPR1P21462 350 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ARF5P84085 180 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZVL8 140 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SERINC5Q86VE9 423 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC15Q8TF66 581 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CD244Q9BZW8 370 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 B4DGG1 531 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 RPL10P27635 214 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SPATS1Q496A3 300 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CEACAM20Q6UY09 585 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC36Q8IYA8 594 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 IL4I1Q96RQ9 567 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MGME1Q9BQP7 344 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 WRBO00258 174 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 JUNP05412 331 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 BCHEP06276 602 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN5P62079 268 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MADCAM1Q13477 382 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 NPAS3Q8IXF0 933 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL36Q8N4N3 616 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ORC5O43913 435 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 COQ9O75208 318 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A4P31645 630 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 BTN3A2P78410 334 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 HSF2Q03933 536 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF678Q5SXM1 525 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 OR9A1PQ8NGU1 263 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 DGAT2Q96PD7 388 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 SERINC1Q9NRX5 453 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 EURLQ9NYK6 297 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 RIMKLBQ9ULI2 386 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0D9SEW6 157 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB2P14652 356 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 KCNC3Q14003 757 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 EOGTQ5NDL2 527 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 IGDCC3Q8IVU1 814 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf43Q8WVR3 580 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 IRF7Q92985 503 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC5Q96C12 935 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 AOC2O75106 756 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 RCBTB2O95199 551 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 DBIP07108 87 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 RORCP51449 518 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 MTTPP55157 894 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 TICAM1Q8IUC6 712 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 STON2Q8WXE9 905 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A13Q96QE2 648 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 OR51B5Q9H339 312 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 TLR4O00206 839 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 GRID2O43424 1007 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 CREG1O75629 220 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM8P78325 824 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 PAMR1Q6UXH9 720 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF280BQ86YH2 543 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 TSPEARQ8WU66 669 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 TMLHEQ9NVH6 421 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK6Q9Y257 313 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 RNF11Q9Y3C5 154 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 TACSTD2P09758 323 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 CXCR1P25024 350 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC12P31275 282 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 VBP1P61758 197 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-203ENST00000366687 RBBP4Q09028 425 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms