RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CLK2-201ENST00000355560 H0Y8X5 98 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 S100A3P33764 101 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CYP2A13Q16696 494 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TRIM15Q9C019 465 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ACTR3BQ9P1U1 418 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PRSS38A1L453 326 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 FPGTO14772 594 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ARPC2O15144 300 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 DFNA5O60443 496 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MYO1DO94832 1006 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ACADSP16219 412 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PHC1P78364 1004 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SELPLGQ14242 412 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 Q6ZS52 159 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 GPR156Q8NFN8 814 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ZUFSPQ96AP4 578 aa24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PRR19A6NJB7 356 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 LRRC72A6NJI9 287 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PDZK1P1A8MUH7 402 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KCNJ13O60928 360 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PRPS1L1P21108 318 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ATP6V1C1P21283 382 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 IDSP22304 550 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KIAA1024LP59773 190 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TFF2Q03403 129 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 LAPTM5Q13571 262 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PGS1Q32NB8 556 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SPIN4Q56A73 249 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 LCN8Q6JVE9 175 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR8J3Q8NGG0 315 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 VCX3BQ9H321 246 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 DMRT3Q9NQL9 472 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 RIMS3Q9UJD0 308 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 AP4S1Q9Y587 144 aa24.75■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ZNF839A8K0R7 811 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 AKAP10O43572 662 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SRFP11831 508 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SOX11P35716 441 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CLCA4Q14CN2 919 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 C17orf64Q86WR6 236 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 LILRA2Q8N149 483 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CDC26Q8NHZ8 85 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PDXPQ96GD0 296 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PIF1Q9H611 641 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SMPDL3AQ92484 453 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR2M4Q96R27 311 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MUC13Q9H3R2 512 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 USP22Q9UPT9 525 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.74■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR52A4PA6NMU1 304 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PSMB5P28074 263 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 NFATC4Q14934 902 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 GPR180Q86V85 440 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ANKRD46Q86W74 232 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 HHIPQ96QV1 700 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PKP2Q99959 881 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KLHL4Q9C0H6 718 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 RMND5AQ9H871 391 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 AQP12BA6NM10 295 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PRMT3O60678 531 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KIR3DL1P43629 444 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 UAP1L1Q3KQV9 507 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CMPK2Q5EBM0 449 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 FAM129CQ86XR2 697 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 AQP12AQ8IXF9 295 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MSRB3Q8IXL7 192 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PGBD3Q8N328 593 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 UBE2E3Q969T4 207 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SLCO4A1Q96BD0 722 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ECSITQ9BQ95 431 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SERHLQ9NQF3 203 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PRDM8Q9NQV8 689 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 EBF1Q9UH73 591 aa24.73■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 B3GALT4O96024 378 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TGFB1P01137 390 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms