RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GPR180Q86V85 440 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 OR8K5Q8NH50 307 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 JADE3Q92613 823 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZNF347Q96SE7 839 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 DOK1Q99704 481 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 SCML1Q9UN30 329 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ASB4Q9Y574 426 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 RAD51CO43502 376 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 NDUFS2O75306 463 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GJB3O75712 270 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 CCNB2O95067 398 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 METTL18O95568 372 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ADH1BP00325 375 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PRPS2P11908 318 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 KRT15P19012 456 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PSMB4P28070 264 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 SERPINA4P29622 427 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GKP32189 559 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PTPN5P54829 565 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ATG16L1Q676U5 607 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 OGFOD2Q6N063 350 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 HORMAD1Q86X24 394 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PGBD3Q8N328 593 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 S100ZQ8WXG8 99 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 MAGED4Q96JG8 741 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PKP4Q99569 1192 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TRIM2Q9C040 744 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 FAM187AA6NFU0 413 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 AIM2O14862 343 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ANGPT2O15123 496 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PSMD3O43242 534 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TXNL1O43396 289 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GPR37L1O60883 481 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 TGM6O95932 706 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 IL1BP01584 269 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GABRG2P18507 467 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 C5AR1P21730 350 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 CA4P22748 312 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 AVPR2P30518 371 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 OXTRP30559 389 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GEMP55040 296 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 COPZ1P61923 177 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PTK6Q13882 451 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 IHHQ14623 411 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 CST6Q15828 149 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 RAB12Q6IQ22 244 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 CASC4Q6P4E1 433 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 CDH24Q86UP0 819 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 JAMLQ86YT9 394 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 LACC1Q8IV20 430 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 LRRC39Q96DD0 335 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-201ENST00000351328 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms