RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 NELL1Q92832 810 aa18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 GLYATL1Q969I3 302 aa18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM64A6NGJ6 449 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 EVPLLA8MZ36 301 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 H3BMQ9 156 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 GSTM1P09488 218 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 IMPA1P29218 277 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 VIPR2P41587 438 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 HLCSP50747 726 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 GSTM4Q03013 218 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 STARD3Q14849 445 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CATSPEREQ5SY80 951 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 LIPIQ6XZB0 460 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP68Q76N32 757 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PLPP6Q8IY26 295 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP206Q8IYR0 622 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CNIH3Q8TBE1 160 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 NEIL2Q969S2 332 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TESCQ96BS2 214 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 COG8Q96MW5 612 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 MYO9BQ13459 2157 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 FKBP9O95302 570 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 MAPK1P28482 360 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 WNT3P56703 355 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CD47Q08722 323 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 SYTL1Q8IYJ3 562 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TRAM1L1Q8N609 369 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF555Q8NEP9 628 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TPD52L3Q96J77 140 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 GULP1Q9UBP9 304 aa18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 WASH3PC4AMC7 463 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ATG13O75143 517 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 RETP07949 1114 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ABHD18Q0P651 414 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 SP140Q13342 867 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CDKL4Q5MAI5 379 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXL8Q96CD0 374 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 SH3BP4Q9P0V3 963 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TRANK1O15050 2925 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ENTPD1P49961 510 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 NXPE3Q969Y0 559 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 OR2AG1Q9H205 316 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PCM1Q15154 2024 aa18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 XPNPEP2O43895 674 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 EPN2O95208 641 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PRPS1L1P21108 318 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CRHBPP24387 322 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DGKGP49619 791 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 VLDLRP98155 873 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DHCR24Q15392 516 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CRTC3Q6UUV7 619 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PARP8Q8N3A8 854 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 LEMD2Q8NC56 503 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 GABRR3A8MPY1 467 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 WNT9AO14904 365 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 KPNA5O15131 536 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 SCN2BO60939 215 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNK5O95279 499 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 FSHRP23945 695 aa18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3-201ENST00000343028 RPS13P62277 151 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms