RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 INAVAQ3KP66 663 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TMEM225Q6GV28 225 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 IGFN1Q86VF2 1251 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DUSP26Q9BV47 211 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 BTBD1Q9H0C5 482 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 COL1A2P08123 1366 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CILPO75339 1184 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 RLN2P04090 185 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CYP3A7P24462 503 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FASLGP48023 281 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 A6NLC8 198 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 HCRTO43612 131 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TYRP14679 529 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GNAZP19086 355 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ITIH1P19827 911 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ACVRL1P37023 503 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NUDT6P53370 316 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 BLMHQ13867 455 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 HM13Q8TCT9 377 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 OR8D2Q9GZM6 311 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TGFB1I1O43294 461 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SCO2O43819 266 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CCNE2O96020 404 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 APLP1P51693 650 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TLE2Q04725 743 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 IFI44LQ53G44 452 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SNX27Q96L92 541 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ASPNQ9BXN1 380 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FN3KQ9H479 309 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 COL20A1Q9P218 1284 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SLC16A5O15375 505 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CCNCP24863 283 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 MLXQ9UH92 298 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CIB4A0PJX0 185 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NUAK1O60285 661 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TPPPO94811 219 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CHRNA1P02708 482 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DGKQP52824 942 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DCDC1P59894 354 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FAM69BQ5VUD6 431 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ARSKQ6UWY0 536 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ALG3Q92685 438 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 MKL1Q969V6 931 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SYT17Q9BSW7 474 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DERAQ9Y315 318 aa10.3□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PTPRUQ92729 1446 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 LRCH4O75427 683 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 HLA-DQB2P05538 268 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 HSD17B2P37059 387 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CDK10Q15131 360 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PLGLAQ15195 96 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 UGT8Q16880 541 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SPRYD7Q5W111 196 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 LCLAT1Q6UWP7 414 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 COMTD1Q86VU5 262 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 MAPK15Q8TD08 544 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NEMP2A6NFY4 417 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 EOGTQ5NDL2 527 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ACBD6Q9BR61 282 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms