RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP45-202ENST00000329966 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP45-202ENST00000329966 PDPRQ8NCN5 879 aa20.13■□□□□ 0.81
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