RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 KCNJ13O60928 360 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 GLULP15104 373 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 FOSL2P15408 326 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MTPNP58546 118 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 RPS13P62277 151 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CYP2A13Q16696 494 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PYCR3Q53H96 274 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 EGLN2Q96KS0 407 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 GUCD1Q96NT3 240 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 RMND5AQ9H871 391 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFV2P19404 249 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 C21orf58P58505 322 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DPY19L1Q2PZI1 675 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 GRAMD1BQ3KR37 738 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SPIN4Q56A73 249 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SFT2D3Q587I9 215 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM92Q6UXU6 159 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SPPL2CQ8IUH8 684 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CHTF18Q8WVB6 975 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-CQ95604 372 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MYOCQ99972 504 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MENTQ9BUN1 341 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 KCNH6Q9H252 994 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SUFUQ9UMX1 484 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 WDR37Q9Y2I8 494 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PRR19A6NJB7 356 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ERN1O75460 977 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 LRATO95237 230 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2E3Q969T4 207 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ITCHQ96J02 903 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SERHLQ9NQF3 203 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 KCNK6Q9Y257 313 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DTNAQ9Y4J8 743 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 A0A096LPI6 279 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CAPNS1P04632 268 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 RAE1P78406 368 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MTAPQ13126 283 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 LRIF1Q5T3J3 769 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MSRB3Q8IXL7 192 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CANT1Q8WVQ1 401 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MSANTD3Q96H12 275 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf66Q96MD2 445 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SPNS1Q9H2V7 528 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ARMC1Q9NVT9 282 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CDH1P12830 882 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CCINQ13939 588 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PGS1Q32NB8 556 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PROSER1Q86XN7 944 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 STARD8Q92502 1023 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SH3GL1Q99961 368 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CD93Q9NPY3 652 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MOSPD1Q9UJG1 213 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 USP22Q9UPT9 525 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 AP3M1Q9Y2T2 418 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DHRS12A0PJE2 317 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SHISA7A6NL88 538 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ASGR2P07307 311 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 KIR3DL1P43629 444 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 OR4D2P58180 307 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1024LP59773 190 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CYP4F3Q08477 520 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 RUNDC3AQ59EK9 446 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 GPR180Q86V85 440 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM69Q86WT6 500 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SMPDL3AQ92484 453 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD8-201ENST00000313173 LATO43561 262 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD8-201ENST00000313173 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXD8-201ENST00000313173 PIK3CBP42338 1070 aa25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms