RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291281.8

PRKD2-201, Transcript of protein kinase D2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKD2, Length 3,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2-201ENST00000291281 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 TTC3P53804 2025 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 H7C0S8 307 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 INSIG1O15503 277 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 PRLP01236 227 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SEMG1P04279 462 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 HSPA7P48741 367 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 LHX8Q68G74 356 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CCRL2O00421 344 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SNX4O95219 450 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF682O95780 498 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 IGLV3-27P01718 113 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 FABP3P05413 133 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SPNP16150 400 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 NR4A2P43354 598 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 P2RX3P56373 397 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 ELP6Q0PNE2 266 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 HORMAD1Q86X24 394 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 FFAR3O14843 346 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 GPR42O15529 346 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 TAPBPO15533 448 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 IDH3BO43837 385 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 PTPN6P29350 595 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 S100A3P33764 101 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CBX5P45973 191 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 DEFA1P59665 94 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 DEFA3P59666 94 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 FAHD1Q6P587 224 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SERPINA11Q86U17 422 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 APH1BQ8WW43 257 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 OARD1Q9Y530 152 aa14.93□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 PCDHGA12O60330 932 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 BCKDHAP12694 445 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CR2P20023 1033 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CLDN8P56748 225 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CARTPTQ16568 116 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SYT16Q17RD7 645 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 METTL4Q8N3J2 472 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 USP7Q93009 1102 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MAGEH1Q9H213 219 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RUBCNLQ9H714 662 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RASSF1Q9NS23 344 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 IL37Q9NZH6 218 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CENPBD1B2RD01 187 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MANBAO00462 879 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MED26O95402 600 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 TBX18O95935 607 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 EBLN1P0CF75 366 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RGRP47804 291 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 NPRL3Q12980 569 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 C4orf46Q504U0 113 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MLIPQ5VWP3 458 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 MIB1Q86YT6 1006 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 COPS4Q9BT78 406 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 NTMT1Q9BV86 223 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 FAM172BPA6NC97 362 aa14.91□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 IQCF5A8MTL0 148 aa14.91□□□□□ -0.02
PRKD2-201ENST00000291281 M0R082 166 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms