RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA4FO95754 770 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN12O95859 305 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A2P52569 658 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 FAM209AQ5JX71 171 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF773Q6PK81 442 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CLIP4Q8N3C7 705 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 SLC31A1O15431 190 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 AP2A2O94973 939 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CD1DP15813 335 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 IGFALSP35858 605 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 NR4A2P43354 598 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MYOCQ99972 504 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 LGR4Q9BXB1 951 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 OR2AG1Q9H205 316 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 OR1A2Q9Y585 309 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 GUCY1B2O75343 617 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 FASP25445 335 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ELK4P28324 431 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK11Q15759 364 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TECRLQ5HYJ1 363 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB2Q8N680 514 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PTERQ96BW5 349 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 LINGO1Q96FE5 620 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM39Q9HCM9 518 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 IKZF3Q9UKT9 509 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS12A0PJE2 317 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf142B7Z368 130 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF10AO00220 468 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MRASO14807 208 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 APBB3O95704 486 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 IL10P22301 178 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CCR7P32248 378 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6AP1Q15904 470 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 USP43Q70EL4 1123 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 SPPL2CQ8IUH8 684 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA2013Q8IYS2 634 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 FRMD1Q8N878 549 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 RLN3Q8WXF3 142 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ASB12Q8WXK4 309 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TEX101Q9BY14 249 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 DERL2Q9GZP9 239 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 WDR26Q9H7D7 661 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 LATS2Q9NRM7 1088 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM181Q9P2C4 612 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 UBDO15205 165 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CDK14O94921 469 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TEAD1P28347 426 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM23P36406 574 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PRLHRP49683 370 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 IL2P60568 153 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 AQP6Q13520 282 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ACAP2Q15057 778 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CYBRD1Q53TN4 286 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ATAD3BQ5T9A4 648 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ISCA2Q86U28 154 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 LILRB4Q8NHJ6 448 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ZFP90Q8TF47 636 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ALG9Q9H6U8 611 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF229Q9UJW7 825 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 RASAL1O95294 804 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CRTC3Q6UUV7 619 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 DDIASQ8IXT1 998 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PARP8Q8N3A8 854 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 FAR2Q96K12 515 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 RMND5AQ9H871 391 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 AKIP1Q9NQ31 210 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MUC3AQ02505 3323 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 SNAP29O95721 258 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G16P53816 162 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 CLCQ05315 142 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 SIGLEC14Q08ET2 396 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 MAPRE2Q15555 327 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 BROXQ5VW32 411 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-201ENST00000265339 DOK6Q6PKX4 331 aa19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms