RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 GSTM1P09488 218 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 GSTM4Q03013 218 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD47Q08722 323 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LMAN2Q12907 356 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MAPK11Q15759 364 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IL26Q9NPH9 171 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 CDK5R2Q13319 367 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 H3BN98 237 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 SLC16A6O15403 523 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RGS5O15539 181 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PI15O43692 258 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1E1P36543 226 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CDH12P55289 794 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.57□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 INMTO95050 263 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 EPORP19235 508 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TIE1P35590 1138 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GSSP48637 474 aa8.57□□□□□ -1.04
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HERC3-201ENST00000264345 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SELPLGQ14242 412 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A4Q969I6 547 aa8.57□□□□□ -1.04
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