RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TLR1Q15399 786 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 LCTLQ6UWM7 567 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 EGLN2Q96KS0 407 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TSSK3Q96PN8 268 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SERTM1A2A2V5 107 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PLIN5Q00G26 463 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MS4A2Q01362 244 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ROPN1LQ96C74 230 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 WDR34Q96EX3 536 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 DPY30Q9C005 99 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ASIC5Q9NY37 505 aa20.38■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 STK25O00506 426 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PSMG1O95456 288 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SDC1P18827 310 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ACTR1BP42025 376 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CCR5P51681 352 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SLC7A2P52569 658 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ACTR1AP61163 376 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 YPEL5P62699 121 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CCNIQ14094 377 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 RCN1Q15293 331 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TAF11Q15544 211 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HOMEZQ8IX15 550 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TSPEARQ8WU66 669 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 STMN2Q93045 179 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 NFYCQ13952 458 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SMPDL3AQ92484 453 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC58Q96CX6 371 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SHDQ96IW2 340 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC42Q9Y546 428 aa20.37■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 LRATO95237 230 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC6Q16204 474 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HAUS8Q9BT25 410 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 EHD1Q9H4M9 534 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ME2P23368 584 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 OXTRP30559 389 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 C17orf64Q86WR6 236 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 GPR156Q8NFN8 814 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.36■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TNFRSF10CO14798 259 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HSD17B2P37059 387 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 RAB28P51157 221 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 COQ5Q5HYK3 327 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 LAS2Q8IYD9 372 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 BRF2Q9HAW0 419 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 KLF15Q9UIH9 416 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ICKQ9UPZ9 632 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 H7BY64 318 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K7O43318 606 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TGFB1P01137 390 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 RABIFP47224 123 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF33BQ06732 778 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms