RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 WLSQ5T9L3 541 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 HID1Q8IV36 788 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 LIX1Q8N485 282 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SMPDL3AQ92484 453 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 STARD8Q92502 1023 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS33AQ96AX1 596 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 BMFQ96LC9 184 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR92Q96MX6 357 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM74Q96NL1 305 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2M4Q96R27 311 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRDQ9H2X0 955 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 NT5DC2Q9H857 520 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 FGF22Q9HCT0 170 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 EBF1Q9UH73 591 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 DMTF1Q9Y222 760 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PRSS38A1L453 326 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PIPSLA2A3N6 862 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 POM121BA6NF01 834 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 C9JVG2 144 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 H0Y3Z8 333 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 KDM1AO60341 852 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO1DO94832 1006 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 C8BP07358 591 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SDC1P18827 310 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PRPS1L1P21108 318 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CXCR2P25025 360 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFS1P28331 727 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB1P30740 379 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 VHLP40337 213 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 ASMTP46597 345 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB28P51157 221 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PHEXP78562 749 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PTGR1Q14914 329 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SPIN4Q56A73 249 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 LAYNQ6UX15 382 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM124AQ86V42 546 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 C17orf64Q86WR6 236 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM129CQ86XR2 697 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT78Q8N1N4 520 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 APOLD1Q96LR9 279 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 C12orf66Q96MD2 445 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 IL17FQ96PD4 163 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 RHBGQ9H310 441 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 FZD3Q9NPG1 666 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CMTM6Q9NX76 183 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC42Q9Y546 428 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PPV9 198 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms