RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000008440.9

SPRTN-201, Transcript of SprT-like N-terminal domain, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPRTN, Length 1,667 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTN-201ENST00000008440 KCNAB1Q14722 419 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF425Q6IV72 752 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF740Q8NDX6 193 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 ACTR8Q9H981 624 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 SNX7Q9UNH6 387 aa20.52■□□□□ 0.88
SPRTN-201ENST00000008440 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 HAT1O14929 419 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 WFS1O76024 890 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CHRNGP07510 517 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CD22P20273 847 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ARRB2P32121 409 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ARL4DP49703 201 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 LCP2Q13094 533 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TRAF3Q13114 568 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ATG9BQ674R7 924 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 PAQR7Q86WK9 346 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CNDP1Q96KN2 507 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 PELI2Q9HAT8 420 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF225Q9UK10 706 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 OR2A25A4D2G3 310 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 HCRTR1O43613 425 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CTSVO60911 334 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CSO75390 466 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SERPINE1P05121 402 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 HSD11B2P80365 405 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 RCN2Q14257 317 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ISXQ2M1V0 245 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 FAM129CQ86XR2 697 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 LSMEM2Q8N112 164 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CARFQ8N187 725 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM74Q96NL1 305 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 NTMT1Q9BV86 223 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.51■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ITM2AO43736 263 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 NPHS1O60500 1241 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 OR4F21O95013 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 MLYCDO95822 493 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 OTCP00480 354 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SH3BP2P78314 561 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CYP4F3Q08477 520 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SYVN1Q86TM6 617 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TCTN2Q96GX1 697 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 DRC3Q9H069 523 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 PDE7BQ9NP56 450 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.5■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 A0A0J9YVX5 310 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 FAM149AA5PLN7 773 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CLDN9O95484 217 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 EBLN1P0CF75 366 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 HRH2P25021 359 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CCKBRP32239 447 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 BST1Q10588 318 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 STX3Q13277 289 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 AGAP11Q8TF27 550 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF382Q96SR6 550 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 EHD1Q9H4M9 534 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms