RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641944.1

CASC19-267, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,117 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-267	ENST00000641944	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	EVPL	Q92817	2033 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CAPN9	O14815	690 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	GLCE	O94923	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NR3C1	P04150	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	FGF5	P12034	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CA4	P22748	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NR2C2	P49116	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	IL10RB	Q08334	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ANO5	Q75V66	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ATP9A	O75110	1047 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CYP2A7	P20853	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NT5C2	P49902	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ZXDB	P98169	803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	TAF13	Q15543	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SGCB	Q16585	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NAGS	Q8N159	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944		A0A0B4J203	849 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SBK2	P0C263	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	CETP	P11597	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NR1D1	P20393	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	DGKA	P23743	735 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SSTR1	P30872	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	KEAP1	Q14145	624 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	HFE	Q30201	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASC19-267	ENST00000641944	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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