RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 REEP1Q9H902 201 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 DMTF1Q9Y222 760 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 OR1F1O43749 312 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 OPN1SWP03999 348 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 GPR150Q8NGU9 434 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 FGF14Q92915 247 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 SCRN2Q96FV2 425 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MYRFLQ96LU7 910 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TEX12Q9BXU0 123 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 LRRC3Q9BY71 257 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 KCNK12Q9HB15 430 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 B4DGG1 531 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 UMPSP11172 480 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ACRV1P26436 265 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 GJA4P35212 333 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP4BP51164 291 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CLCN4P51793 760 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 FOXA1P55317 472 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 NUP107P57740 925 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ISL2Q96A47 359 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF382Q96SR6 550 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.98□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 DYRK3O43781 588 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ARNTP27540 789 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 LAPTM5Q13571 262 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 SEMA3AQ14563 771 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CHSY3Q70JA7 882 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ADCK1Q86TW2 530 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TEX26Q8N6G2 289 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CEP19Q96LK0 163 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CGREF1Q99674 301 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CHID1Q9BWS9 393 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 AMBNQ9NP70 447 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 PALMDQ9NP74 551 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 EXD2Q9NVH0 621 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 C3orf18Q9UK00 162 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 A0A1B0GVG6 124 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 GSRP00390 522 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 IL6P05231 212 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 PRPS2P11908 318 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MAGEA12P43365 314 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 SPINT3P49223 89 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC7A9P82251 487 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 HYAL1Q12794 435 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 EPS8Q12929 822 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TSSK4Q6SA08 328 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 MICU2Q8IYU8 434 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 GPR26Q8NDV2 337 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 LCN9Q8WX39 176 aa8.97□□□□□ -0.97
PNMA8C-201ENST00000617053 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms