RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	HOXC12	P31275	282 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	RELT	Q969Z4	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CFL2	Q9Y281	166 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	KLF11	O14901	512 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ANXA8	P13928	327 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF823	P16415	610 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	MYBPC3	Q14896	1274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SLC30A4	O14863	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	IDH3B	O43837	385 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PROZ	P22891	400 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	B4GALT2	O60909	372 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GRIA2	P42262	883 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	DHCR24	Q15392	516 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	NODAL	Q96S42	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TGM5	O43548	720 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TSPAN6	O43657	245 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GSR	P00390	522 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CASR	P41180	1078 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SCAP	Q12770	1279 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	QPRT	Q15274	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TP53INP1	Q96A56	240 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	LATS1	O95835	1130 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CTSA	P10619	480 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PAX7	P23759	505 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	S100G	P29377	79 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GJA5	P36382	358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SEPHS1	P49903	392 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	HYAL2	Q12891	473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CD244	Q9BZW8	370 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	SHMT2	P34897	504 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151		Q9N2J8	555 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	VIPR2	P41587	438 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB18-208	ENST00000611151	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26

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