RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	RELT	Q969Z4	430 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SEC16A	O15027	2179 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	E2F3	O00716	465 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CES2	O00748	559 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	JRK	O75564	520 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	USP1	O94782	785 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	GRIA3	P42263	894 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	GRM7	Q14831	915 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TLR1	Q15399	786 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OR2L3	Q8NG85	312 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PTER	Q96BW5	349 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SPTB	P11277	2137 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PDZD2	O15018	2839 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1B0GX78	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MAGEA3	P43357	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CASP6	P55212	293 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CTBP1	Q13363	440 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MIPEP	Q99797	713 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1W2PPV9	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	DSCR3	O14972	297 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CTSV	O60911	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ONECUT2	O95948	504 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ALB	P02768	609 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CD1E	P15812	388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PSMB5	P28074	263 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CMPK1	P30085	196 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	HSD17B2	P37059	387 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	GCGR	P47871	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CLCN7	P51798	805 aa		13.62	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms