RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 OARD1Q9Y530 152 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GNGT2O14610 69 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 C1SP09871 688 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SPESP1Q6UW49 350 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FAM162AQ96A26 154 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PCM1Q15154 2024 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 COPZ1P61923 177 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ATP6AP1Q15904 470 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 INAVAQ3KP66 663 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ARSIQ5FYB1 569 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PDPRQ8NCN5 879 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FANCEQ9HB96 536 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PADI4Q9UM07 663 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SHMT2P34897 504 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PPP2R2BQ00005 443 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZBED5Q49AG3 693 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TMC8Q8IU68 726 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FRS2Q8WU20 508 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ELMO1Q92556 727 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ACDQ96AP0 544 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SCRN2Q96FV2 425 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 RGS14O43566 566 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CYP4B1P13584 511 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 AQP1P29972 269 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CYP4F3Q08477 520 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PMS2P3Q13401 168 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MPPE1Q53F39 396 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GPR156Q8NFN8 814 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 NETO1Q8TDF5 533 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 VPS35Q96QK1 796 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LEFTY1O75610 366 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZNF682O95780 498 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ANXA5P08758 320 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MSL3P1P0C860 447 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MLLT10P55197 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FIBINQ8TAL6 211 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB18Q99592 522 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PPT2Q9UMR5 302 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GFRA2O00451 464 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CLDN9O95484 217 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CST1P01037 141 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TYRP14679 529 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 IDUAP35475 653 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 NSG1P42857 185 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CTSCP53634 463 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 P2RX3P56373 397 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PWP1Q13610 501 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms