RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	BECN2	A8MW95	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DHH	O43323	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CTSB	P07858	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CYC1	P08574	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SKIL	P12757	684 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TNNT1	P13805	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	VIPR1	P32241	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ACVRL1	P37023	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SYK	P43405	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CSNK1D	P48730	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HLCS	P50747	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	RAD23B	P54727	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	FANCC	Q00597	558 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	OCA2	Q04671	838 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GALNT3	Q14435	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	STIL	Q15468	1287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	IL17A	Q16552	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	P3H1	Q32P28	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	M1AP	Q8TC57	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MED15	Q96RN5	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PP18	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772		H3BRJ5	948 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN34	H7C241	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KDELR3	O43731	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SMC2	O95347	1197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ALAS2	P22557	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	AMPD1	P23109	780 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	UGT2B10	P36537	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PRPH	P41219	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HAL	P42357	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SLC6A12	P48065	614 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CASP5	P51878	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ITGA8	P53708	1063 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	EMP2	P54851	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CDH15	P55291	814 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	WNT3	P56703	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	JAM2	P57087	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	RPE65	Q16518	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TAZ	Q16635	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	INSC	Q1MX18	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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