RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579916.5

CCDC178-208, Transcript of coiled-coil domain containing 178, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC178, Length 1,017 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC178-208	ENST00000579916	ALG14	Q96F25	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NPY6R	Q99463	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	LRP4	O75096	1905 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SPEG	Q15772	3267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		A0A1W2PR77	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		E9PAM4	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		F8VZ95	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MCF2L	O15068	1137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ALOX15B	O15296	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC7A4	O43246	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TNFSF14	O43557	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	LAT	O43561	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SNAP91	O60641	907 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	GFPT2	O94808	682 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	F9	P00740	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TPM2	P07951	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SRC	P12931	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	OR1E1	P30953	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	GABRB2	P47870	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CCT5	P48643	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC37A1	P57057	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	KRT83	P78385	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SRL	Q86TD4	932 aa		4.6	□□□□□ -1.67
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CCDC178-208	ENST00000579916	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	EMC1	Q8N766	993 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PSMB7	Q99436	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		A0A0D9SEW6	157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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