RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	SLC16A8	O95907	504 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FUCA1	P04066	466 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRR35	P0CG20	571 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	COX4I1	P13073	169 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HMOX2	P30519	316 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OXTR	P30559	389 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	AKT2	P31751	481 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MNAT1	P51948	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CLDN2	P57739	230 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KCNJ2	P63252	427 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NAE1	Q13564	534 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PTK2B	Q14289	1009 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NFATC4	Q14934	902 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	INAVA	Q3KP66	663 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PYCR3	Q53H96	274 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OGFOD2	Q6N063	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR2T11	Q8NH01	316 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR56A3	Q8NH54	315 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF480	Q8WV37	535 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PYCR2	Q96C36	320 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MIPEP	Q99797	713 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SUFU	Q9UMX1	484 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MEI4	A8MW99	385 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		H0Y8X5	98 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MANBA	O00462	879 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TOR1B	O14657	336 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	UGDH	O60701	494 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	DKK1	O94907	266 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RPN2	P04844	631 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IGHV4-34	P06331	123 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KRT16	P08779	473 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ERG	P11308	486 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ACP5	P13686	325 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CD46	P15529	392 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LBP	P18428	481 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KEL	P23276	732 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CD6	P30203	668 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GNPDA1	P46926	289 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CPA2	P48052	419 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	STX1B	P61266	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TBPL1	P62380	186 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	YPEL5	P62699	121 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KCNC4	Q03721	635 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GRIK2	Q13002	908 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GRB7	Q14451	532 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GSTA3	Q16772	222 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PCSK4	Q6UW60	755 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RINL	Q6ZS11	566 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SFRP1	Q8N474	314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FBXO27	Q8NI29	283 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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