RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 LIASO43766 372 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 BMP10O95393 424 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 HEXBP07686 556 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 APRTP07741 180 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 ETS1P14921 441 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 ART3Q13508 389 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 NAA25Q14CX7 972 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 INAQ16352 499 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 PCID2Q5JVF3 399 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 LRRC6Q86X45 466 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 OR2A25A4D2G3 310 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 VPS26AO75436 327 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 RASAL1O95294 804 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 CELA2AP08217 269 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 ANXA5P08758 320 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SNX1Q13596 522 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 C14orf105Q9NVL8 296 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 CCL21O00585 134 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 UNC5CO95185 931 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 WDPCPO95876 746 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.189e-7■■■■□ 24.6
CS-214ENST00000548849 FMO4P31512 558 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 EMP3P54852 163 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 CRADDP78560 199 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 KIF5AQ12840 1032 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 DSG2Q14126 1118 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 HKDC1Q2TB90 917 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 CCDC89Q8N998 374 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 MVB12AQ96EY5 273 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 HES6Q96HZ4 224 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 PAK5Q9P286 719 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-214ENST00000548849 CRYABP02511 175 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 MYBL2P10244 700 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 ITGAMP11215 1152 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 ICAM2P13598 275 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 MST1P26927 711 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 NMBRP28336 390 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 SLC26A3P40879 764 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 MPP5Q8N3R9 675 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 SMPDL3AQ92484 453 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 FAM136AQ96C01 138 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 CCDC120Q96HB5 630 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 TREX1Q9NSU2 369 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 ABI3Q9P2A4 366 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 A0A0U1RQJ8 604 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PQ72 361 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 PHF2O75151 1096 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 NIPSNAP2O75323 286 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 MATN4O95460 622 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 CHRM3P20309 590 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 AP2B1P63010 937 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 RBPJQ06330 500 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 PCOLCEQ15113 449 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 SYT16Q17RD7 645 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-214ENST00000548849 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms