RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 VSTM4Q8IW00 320 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 Q96MF0 132 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNK13Q9HB14 408 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 GLOD4Q9HC38 313 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 Q9UFV3 132 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 ARL5AQ9Y689 179 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-216ENST00000545663 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 NME2P1O60361 137 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 TFEBP19484 476 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 NME2P22392 152 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ACADLP28330 430 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 GJC1P36383 396 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF75DP51815 510 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 WNT3AP56704 352 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 MEP1AQ16819 746 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CNGA4Q8IV77 575 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 AMER3Q8N944 861 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 OR2W5A6NFC9 320 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC25A12O75746 678 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SUN1O94901 812 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 GLI4P10075 376 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CDC25BP30305 580 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 UQCRC1P31930 480 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 XIAPP98170 497 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 RPA4Q13156 261 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 KCTD6Q8NC69 237 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 IL17FQ96PD4 163 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 POLG2Q9UHN1 485 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ALG6Q9Y672 507 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SCN2AQ99250 2005 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 A0A0J9YVX5 310 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PRMT3O60678 531 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 RALBP11234 206 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ADH7P40394 386 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC14A2Q15849 920 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SLCO2A1Q92959 643 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 COPS8Q99627 209 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 HACD3Q9P035 362 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SCINQ9Y6U3 715 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 DNAJC13O75165 2243 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 AGAP14A8MT82 685 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF9O43307 516 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 PKLRP30613 574 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC26A3P40879 764 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 GXYLT1Q4G148 440 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 P3H2Q8IVL5 708 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM222BQ8WU58 562 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 MENTQ9BUN1 341 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-216ENST00000545663 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms