RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 EPB42P16452 691 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TYRP1P17643 537 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TSPAN8P19075 237 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PDX1P52945 283 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 FOXA1P55317 472 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GFERP55789 205 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR1D5P58170 312 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GPLD1P80108 840 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ABATP80404 500 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ASPHQ12797 758 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GTF2H2Q13888 395 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PLCL1Q15111 1095 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TBCCQ15814 346 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ZIC1Q15915 447 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SPESP1Q6UW49 350 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GLRX5Q86SX6 157 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CUZD1Q86UP6 607 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM73Q86UV7 250 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OOSP2Q86WS3 158 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR10G6Q8NH81 332 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 C7orf26Q96N11 449 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SLC38A3Q99624 504 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 HAUS8Q9BT25 410 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SARGQ9BW04 601 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ABCG4Q9H172 646 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 IPPKQ9H8X2 491 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ATRXP46100 2492 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CPED1A4D0V7 1026 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM233B4DJY2 109 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF195O14628 629 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 UGDHO60701 494 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 KATNA1O75449 491 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 FKBP9O95302 570 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 ESRRBO95718 433 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 MLYCDO95822 493 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 OTCP00480 354 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 FGF4P08620 206 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 EBLN1P0CF75 366 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 CDH1P12830 882 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 GNAZP19086 355 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 MAGP20916 626 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 MPSTP25325 297 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 ALDH4A1P30038 563 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 GRIA3P42263 894 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 GABRA4P48169 554 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 SLC1A6P48664 564 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 PKNOX1P55347 436 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 CSNK1G2P78368 415 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 REEP5Q00765 189 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 RELAQ04206 551 aa7.52□□□□□ -1.21
C16orf62-211ENST00000540101 STX3Q13277 289 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms