RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 DFNA5O60443 496 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFV2P19404 249 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 SOX11P35716 441 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 OR4D2P58180 307 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCQQ04759 706 aa19.61■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 GLYATQ6IB77 296 aa19.61■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 USP22Q9UPT9 525 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 AP3M1Q9Y2T2 418 aa19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 GMNNO75496 209 aa19.6■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 EOGTQ5NDL2 527 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP4R4Q6NUP7 873 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP206Q8IYR0 622 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D21Q8IYX1 336 aa19.6■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 APIPQ96GX9 242 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 MSANTD3Q96H12 275 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 AK5Q9Y6K8 562 aa19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 C7orf72A4D263 438 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 S100A3P33764 101 aa19.59■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 RPS21P63220 83 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK3Q00526 305 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CCSMST1Q4G0I0 132 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM124AQ86V42 546 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PACRGLQ8N7B6 248 aa19.59■□□□□ 0.73
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PACSIN3-211ENST00000539589 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TPST1O60507 370 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CKMT2P17540 419 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 AMD1P17707 334 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 IMPA1P29218 277 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN2P51788 898 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2CBP62714 309 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2CAP67775 309 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDH1Q08174 1060 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 DOC2AQ14183 400 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf96Q7Z7L8 435 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 OR56A3Q8NH54 315 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TESCQ96BS2 214 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 APOLD1Q96LR9 279 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TSSK3Q96PN8 268 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 GBP5Q96PP8 586 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CA14Q9ULX7 337 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 SCML1Q9UN30 329 aa19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 E7EQ34 232 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 ERN1O75460 977 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNB1P11230 501 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 GABRG2P18507 467 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 SDC1P18827 310 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CD22P20273 847 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP4F3Q08477 520 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP7Q14244 749 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 GRHL2Q6ISB3 625 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 DTWD1Q8N5C7 304 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2T12Q8NG77 320 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR20Q8TBZ3 569 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF583Q96ND8 569 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX101Q9BY14 249 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC17A9Q9BYT1 436 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 FZD4Q9ULV1 537 aa19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAB1Q9Y478 270 aa19.58■□□□□ 0.73
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