RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 MNDAP41218 407 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CTBP2P56545 445 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CLRN1P58418 232 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HERVK_113P63132 956 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MAPK11Q15759 364 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CST9Q5W186 159 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PARP8Q8N3A8 854 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GDE1Q9NZC3 331 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RAB21Q9UL25 225 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2QL1A1L167 161 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF623O75123 536 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TULP3O75386 442 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CHAF1BQ13112 559 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR1A2Q9Y585 309 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF12O95522 483 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 LATS1O95835 1130 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 IFNA6P05013 189 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 C6P13671 934 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CD72P21854 359 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 IGFBP5P24593 272 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HHEXQ03014 270 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CD47Q08722 323 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 IFI44LQ53G44 452 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZVL8 140 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NATD1Q8N6N6 113 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 AP3S1Q92572 193 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SIX4Q9UIU6 781 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD3Q9Y597 815 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TAF4O00268 1085 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 EDNRBP24530 442 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DSTNP60981 165 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 LIPEQ05469 1076 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 INCA1Q0VD86 236 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SYVN1Q86TM6 617 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PIM3Q86V86 326 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TDHQ8IZJ6 230 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GIN1Q9NXP7 522 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DHRS7Q9Y394 339 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087WXM4 84 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TNFRSF10BO14763 440 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PMM2O15305 246 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GADD45GO95257 159 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGDIBP52566 201 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF846Q147U1 533 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 LIN54Q6MZP7 749 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 APCDD1Q8J025 514 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FOLR3P41439 243 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SMCO1Q147U7 214 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TAB1Q15750 504 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RAB43Q86YS6 212 aa9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms