RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CUZD1	Q86UP6	607 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PLD3	Q8IV08	490 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CD200R1	Q8TD46	325 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ASB11	Q8WXH4	323 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	C8orf44	Q96CB5	159 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PWWP2A	Q96N64	755 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	GPR21	Q99679	349 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	WDR54	Q9H977	334 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TAC3	Q9UHF0	121 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CDC23	Q9UJX2	597 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CTAGE9	A4FU28	777 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517		H3BMM5	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	GFY	I3L273	518 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PHF2	O75151	1096 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	VPS4B	O75351	444 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	FKBP9	O95302	570 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	DSG2	Q14126	1118 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	HIF1A	Q16665	826 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SMPDL3A	Q92484	453 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	FOPNL	Q96NB1	174 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IP6K3	Q96PC2	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2A5	Q96R48	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	NDN	Q99608	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	C5AR2	Q9P296	337 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	VPS4A	Q9UN37	437 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	DHRS7	Q9Y394	339 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MAGEB16	A2A368	324 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517		E5RI56	91 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	FOXS1	O43638	330 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ERVK-10	P10266	1014 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PAM	P19021	973 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ITGA3	P26006	1051 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IVD	P26440	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IMPA1	P29218	277 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CMPK1	P30085	196 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	KLC1	Q07866	573 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SYT16	Q17RD7	645 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ICE2	Q659A1	982 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517		Q6ZS92	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	AMER3	Q8N944	861 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	KCNJ9	Q92806	393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CACNA1D	Q01668	2161 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	USP27X	A6NNY8	438 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SMAP	O00193	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	HAT1	O14929	419 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	KLHL18	O94889	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CELA2A	P08217	269 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CD63	P08962	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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