RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 GRHL3Q8TE85 626 aa18.37■□□□□ 0.53
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRPC4Q9UBN4 977 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-220ENST00000511663 NTNG1Q9Y2I2 539 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-220ENST00000511663 CSAG2Q9Y5P2 127 aa18.37■□□□□ 0.53
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SH3BP2-220ENST00000511663 CTAGE9A4FU28 777 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP2-220ENST00000511663 TAC3Q9UHF0 121 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-220ENST00000511663 PAQR7Q86WK9 346 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 C10orf90Q96M02 699 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 OLAHQ9NV23 265 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 GALPQ9UBC7 116 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 PCM1Q15154 2024 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.32■□□□□ 0.52
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